由加州大学河滨分校的科学家领导的一个研究小组已经开发出一种计算工作流程，用于分析代谢组学领域的大型数据集，代谢组学研究细胞、生物流体、组织和整个生态系统中的小分子。

最近，该团队应用这种新的计算工具来分析南加州海水中的污染物。该团队迅速捕获了沿海环境的化学特征，并突出了潜在的污染源。

“我们有兴趣了解这些污染物是如何进入生态系统的，”领导该研究小组的加州大学河滨分校生物化学助理教授丹尼尔·佩特拉斯(Daniel Petras)说。“由于海洋的化学多样性，弄清楚海洋中的哪些分子对环境健康很重要并不容易。我们开发的协议大大加快了这一进程。更有效的数据分类意味着我们可以更快地了解与海洋污染有关的问题。”

佩特拉斯和他的同事在《自然协议》杂志上报告说，他们的协议不仅是为有经验的研究人员设计的，也是为了教育目的，使其成为学生和早期职业科学家的理想资源。这个计算工作流程伴随着一个带有图形用户界面的可访问的web应用程序，使非专家也可以访问代谢组学数据分析，并使他们能够在几分钟内获得对数据的统计见解。

UCR计算机科学与工程助理教授、合著者王明勋说:“这个工具适用于广泛的研究人员，从绝对的初学者到专家，它是为与我的团队正在开发的分子网络软件结合使用而量身定制的。”“对于初学者来说，我们提供的指南和代码使他们更容易理解常见的数据处理和分析步骤。对于专家来说，它加速了可重复的数据分析，使他们能够分享他们的统计数据分析工作流和结果。”

佩特拉斯解释说，这篇研究论文是独一无二的，它是一个名为虚拟多组学实验室(virtual Multiomics Lab，简称VMOL)的虚拟研究小组组织的大型教育资源。VMOL是一个社区驱动的开放获取社区，来自世界各地的50多名科学家参与其中。它旨在简化和民主化化学分析过程，使全世界的研究人员都可以使用它，无论他们的背景或资源如何。

佩特拉斯小组的博士生、该论文的第一作者阿布泽尔·帕克基尔·沙阿(Abzer Pakkir Shah)说:“我非常自豪地看到，这个项目如何演变成一个有影响力的项目，涉及到来自全球各地的专家和学生。”“通过消除物理和经济障碍，VMOL提供计算质谱和数据科学方面的培训，旨在启动虚拟研究项目，作为一种新的合作科学形式。”

该团队开发的所有软件都是免费和公开的。该软件开发是在2022年 宾根大学非靶向代谢组学暑期学校期间启动的，该团队也在那里推出了VMOL。

佩特拉斯预计，该协议将对环境研究人员、从事生物医学领域工作的科学家以及从事微生物组科学临床研究的研究人员特别有用。

他说:“我们的方案的多功能性扩展到广泛的领域和样品类型，包括组合化学，兴奋剂分析，以及食品，药品和其他工业产品的微量污染。”

他在达姆施塔特应用科学大学获得生物技术硕士学位，在柏林技术大学获得生物化学博士学位。他在加州大学圣地亚哥分校做博士后研究，专注于大规模环境代谢组学方法的发展。2021年，他在 宾根大学启动了功能代谢组学实验室。2024年1月，他加入了UCR，在那里他的实验室专注于开发和应用基于质谱的方法，以可视化和评估微生物群落内的化学交换。